Als die Sozialversicherungsnummer einer jungen Staatsanwältin auftaucht, kann Finch Reese davon überzeugen ihm dabei zu helfen, herauszufinden, ob es sich bei ihrer Zielperson um das Opfer oder den Täter handelt. Bei der Überwachung der jungen Frau entdeckt Rees mehrere Akteure, die in ein Komplott gegen die Staatsanwaltschaft beteiligt sein könnten. Aber noch immer ist nicht klar, ob DA Hanson nun Täter oder Opfer sein wird. Ebenso scheint Det. Lionel Fusco, ein offensichtlich korrupter Cop, ganz tief drin zu stecken. Rees hat allerdings die Mittel und Fähigkeiten, sich Klarheit zu verschaffen. Dies ruft allerdings Det. Joss Carter auf den Plan, die nun zur Jagd auf den "Mann im Anzug" bläst.

Finch und Rees haben eine neue Nummer. Finch stellt allerdings erstaunt fest, dass die fünfzehnjährige Theresa Whitaker zusammen mit ihrer Familie auf dem Calvary Cemetery in Queens begraben liegt. Rees schaut sich die Verwandtschaft der Familie näher an und kommt schnell dahinter, was passiert ist. Theresa hat allerdings sehr gute Fähigkeiten entwickelt, unterzutauchen. Als er das Mädchen endlich aufspüren kann ist ihr ein Auftragskiller schon gefährlich nahe gekommen. Äußerst hinderlich ist auch, dass Det. Carter ihm dicht auf den Fersen ist.

Reese verfolgt einen aus dem Krieg heimgekehrten Ex-Soldaten und stellt fest, dass er einer Bankräuberbande aus Ex-Soldaten angehört. Scheinbar wird diese von einem ehemaligen Master Sergeant angeführt. Reese gelingt es sich dort einzuschleichen und versucht herauszufinden, welcher Art die Bedrohung ist. Derweil erlangt Carter neue Erkenntnisse über den "Mann im Anzug".

Finch konsultiert Dr. Megan Tillman im Krankenhaus wegen eines neuen Rezepts für Schmerzmittel. Unbemerkt tauscht er ihren Pager aus denn sie ist die neue Nummer, die in Schwierigkeiten steckt. Verwundert stellt Rees fest, dass sie nach 12-Stunden Schichten noch durch die Clubs zieht. Dort wittert er ziemlich schnell Gefahr, denn ein Investmentbanker entpuppt sich als Sexualstraftäter. Und dieser verfolgt nicht die Ärztin, sondern sie ihn. Rees beginnt zu ahnen, worum es hier geht.

Cater verbeißt sich immer mehr in ihre Jagd auf Rees und spürt Finch in einer seiner Tarnidentitäten auf. Fusco wird zum 8. Revier versetzt.

Die Maschine weist auf einen Richter hin, dessen Urteil in einem offenbar eindeutigen Fall in Kürze erwartet wird. Doch es kommt zu einer überraschenden Wendung, als Gangster den Sohn des Richters entführen.

Reese tarnt sich als Chauffeur einer hoch-karätigen Managerin, die sich auf Lösungen brisanter Probleme spezialisiert hat. Er versucht herauszubekommen, wer diese attraktive Frau umbringen will. Zoe Morgan ist allerdings keine Frau, die sich so einfach beschützen lässt. Ihr aktueller Auftrag ist es einen USB-Stick mit brisanten Informationen sicherzustellen, die den CEO der Pharmariesen Virtanen in arge Bedrängnis bringen könnte. Finch beschließt in die Firma zu investieren um Zugang zu dem Unternehmen zu bekommen.

Nach einem Mafia-Auftragsmord in Brighton Beach steht Reese einem Lehrer bei, der Zeuge des Anschlags war.

Alte Schule - neue Schule: Ein flüchtiger Spion aus der Zeit des Kalten Krieges taucht wieder auf und gerät als interessante Person ins Visier des Teams.

Reese und Finch haben sich Detective Carters Ermittlungen bisher immer entziehen können. Fliegt ihre Tarnung jetzt auf, als Carter selbst zur interessanten Person wird?

Carter hat Elias' Anschlag überlebt und wird zum Innendienst verdonnert. Man verdächtigt sie sogar mit dem Mann im Anzug unter einer Decke zu stecken. Zu allem Überfluss wird sie zum Captain zitiert und muss Fragen eines namenlosen Anzugträgers beantworten.

Derweil spuckt die Maschine vier Nummern gleichzeitig aus. Das bringt Team Machine in Personalnot und eine der Nummern wird ermordet bevor Rees eingreifen kann. Die Recherchen führt sie zu einem Abgeordneten und zu dessen Sohn, der einen tödliche Autounfall hatte. Was hatten die vier damit zu tun?

Carter versucht Fusco vom Schreibtisch aus bei den Ermittlungen des Mordes zu helfen, doch plötzlich wird sie von der CIA in die Zange genommen die an Rees rankommen will.

Reese und Finch ziehen in einen Apartmentkomplex, um eine interessante Person zu überwachen: den Hausverwalter. Gleichzeitig versucht Carter, Finch auf die Schliche zu kommen. In einer Rückblende erfahren wir mehr über die Startphase der Maschine

Reese bekommt den Auftrag, eine junge Anwältin zu schützen, die sich um Strafgefangene kümmert, die sonst niemand vertreten will. Finchs Vergangenheit wird bekannt, als der Sohn seines ehemaligen Geschäftspartners in die Stadt zurückkehrt.

Als man einem Arbeitslosen einen Mord unterschieben will, versuchen Reese und Finch der Verschwörung hinter dem Mord auf den Grund zu gehen.

Reese bringt einem rachsüchtigen Teenager bei, wie er dabei vorgehen kann, ohne das es Tote gibt. Finch mauert weiter, wenn es um die Details seiner Vergangenheit geht.

Ein Undercover-Cop, der sich in einen Schmugglerring eingeschleust hat, ist diesmal die interessante Person für das Team. Im Auftrag von Reese soll Fusco die geheimen Akten der New Yorker Polizei einsehen.

Unsere Helden legen sich mit Investoren an, als sie einen Wall-Street-Banker schützen wollen. Durch diesen Fall wird Reese mit seiner schlimmsten Vergangenheit konfrontiert.

Reese bekommt von unerwarteter Seite Hilfe, als er sich um die nächste interessante Person kümmert, die erst sechs Monate alt ist. Carter beschließt, dass sie mit Reese' und Finchs Selbstjustiz-Feldzug nichts mehr zu tun haben will.

Zwei Personen benutzen denselben Namen und dieselbe Sozialversicherungsnummer. Wer ist die interessante Person und wer ist der Betrüger?

Elias plant, seinen Mafia-Rivalen umzubringen. Reese, Finch und die New Yorker Polizei geraten daher in die unangenehme Situation, ihre Feinde beschützen zu müssen.

Reese wird Mitglied eines Panzerwagenteams, um herauszufinden, warum ein Wachmann bedroht wird. Rückblenden zeigen eine entscheidende Phase aus Reese' Vergangenheit.

"Wir haben nichts auf dem Terminkalender."

Finch informiert Reese nicht über die neueste Nummer und Carter spielt für das Team den Maulwurf, als durch eine neue FBI-Ermittlung auch Reese ins Visier gerät.

Gefährliches Wissen: Ein Unbekannter könnte hinter das Geheimnis der Maschine kommen. Reese forscht in Finchs Vergangenheit nach.

Eine Psychiaterin gerät ins Visier von korrupten Cops und Reese muss sie schützen, wobei er in einem Hotel fast dem FBI in die Falle geht.