Der Tod eines amerikanischen Matrosen auf einem US-Atom-U-Boot während einer AUKUS-Zeremonie im Hafen von Sydney wird in einer gemeinsamen Aktion von amerikanischen NCIS-Agenten und der australischen Bundespolizei (AFP) untersucht.

Als ein Navy-Compliance-Offizier nach einem Schlangenbiss tot in einem Wasserloch aufgefunden wird, arbeitet das Team daran, die Herkunft des seltenen, tödlichen Taipans herauszufinden, der in dem Gebiet, in dem der Offizier gefunden wurde, ungewöhnlich ist.

Als ein Hai einen Arm ausspuckt, der eine Ausrüstung der U.S. Navy trägt, stellt die Untersuchung des Teams die Loyalität einer Gruppe ehemaliger Navy-Taucher auf die Probe.

Als die Leiche eines US-Unteroffiziers in Sydneys historischem Geisterviertel Rocks gefunden wird, birgt eine jahrzehntealte Navy-Cross-Medaille den Schlüssel zur Lösung des Mordes und führt das Team auf eine wilde Geisterjagd, um einen Mörder zu fangen.

Das Team rennt los, um einen von ihnen zu retten, als Doc Roy und sein Hund in eine Geiselnahme in ihrem örtlichen Hundecafé verwickelt werden.

Ein Mann in einer kaschierten US-Navy-Jacke erliegt in einem überfüllten Bus in Bondi einer Kokain-Überdosis, wodurch Evie (Tuuli Narkle) in ihre Vergangenheit als Undercover-Drogenfahnderin zurückversetzt wird.

Ein beeindruckender Tech-Launch wir zu einer Katastrophe, die die Hälfte des NCIS-Sydney-Teams unter der Erde begräbt. Die verbleibenden Agenten versuchen ihre Kollegen zu retten, bevor ihnen der Sauerstoff ausgeht.

JDs Sohn wird von einem internationalen Verbrecher entführt. Im Austausch gegen den Jungen fordert der Attentäter die Freilassung eines gesuchten Kriminellen, der sich in Gewahrsam der NCIS befindet. Das Team versucht verzweifelt JDs Kind zu retten, ohne einen Gefangenenaustausch.