Der finale Konflikt mit der Armee der 12 Monkeys beginnt als der Zeuge zum Prohekt Splinter zurückkehrt.

Die Zeitreisenden müssen sich Geistern ihrer Vergangenheit stellen als sie sich durch ihre eigenen Zeitstrahlen manövrieren.

Cassie reist in der Zeit zurück um eine jüngere Olivia zu konfrontieren. Cole hilft Jennifer dabei, die Bedeutung ihrer Vision zu finden.

Das Team Splinter reist in die Zeit der Besiedelung Amerikas zurück um eine Waffe zu suchen, die den Zeugen zerstören könnte.

Ein Hinweis, wie sie den Zyklus durchbrechen könnten, führt Cassie und Cole in die 1960er Jahre.

Das Team infiltriert eine Nazi-Veranstaltung um ein Artefakt namens "Die Glocke" zu stehlen. Ihre Operation wird durch den französischen Widerstand gestört, außerdem trifft ein unerwarteter Gast ein.

Jones schickt Hannah auf eine persönliche Mission zurück ins Jahr 2007, die der Schlüssel zu allem sein könnte.

Alles verändert sich als das Team endlich die Glocke im Mittelalter läutet.

Cassie und Cole machen sich zu ihrer letzte Mission auf und der Anfang vom Ende beginnt.

Der Endkampf gegen den Zeugen beginnt und das Schicksal der Zeit und der Menschheit droht aus der Balance zu geraten. Alle Puzzleteile kommen zusammen und markieren den Anfang des Endes

Als jede Hoffnung verloren ist, muss Cole seinen Zyklus vollenden, so dass sein jüngeres Selbst eines Tages erscheinen kann und die Antwort mit sich bringt.